Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms