Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkceP16054 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms