Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnc1P15388 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms