Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtcP11725 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtcP11725 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtcP11725 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtcP11725 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtcP11725 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtcP11725 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms