Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa1P11477 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa1P11477 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms