Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms