Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp1P11103 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp1P11103 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Parp1P11103 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Parp1P11103 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms