Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcea1P10711 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms