Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl2P10148 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms