Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms