Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms