Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms