Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprqP0C5E4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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