Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ifna9P09235 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ifna9P09235 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms