Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtaP09225 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtaP09225 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtaP09225 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtaP09225 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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