Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc8P09025 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms