Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sod1P08228 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sod1P08228 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms