Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms