Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06324 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06324 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06324 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06324 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06324 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06324 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06324 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06324 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06324 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms