Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JunP05627 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JunP05627 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JunP05627 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JunP05627 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JunP05627 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JunP05627 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JunP05627 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JunP05627 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JunP05627 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms