Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms