Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04213 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04213 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04213 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04213 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms