Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt1P04104 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms