Protein–RNA interactions for Protein: P03976

Ig kappa chain V-II region 17S29.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03976 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P03976 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P03976 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P03976 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P03976 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P03976 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms