Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrndP02716 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrndP02716 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms