Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01808 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01808 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01808 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01808 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01808 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01808 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01808 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01808 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01808 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms