Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifnb1P01575 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifnb1P01575 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms