Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MscO88940 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MscO88940 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MscO88940 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms