Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CcnkO88874 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnkO88874 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CcnkO88874 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CcnkO88874 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CcnkO88874 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnkO88874 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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