Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cops6O88545 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cops6O88545 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cops6O88545 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cops6O88545 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cops6O88545 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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