Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dll3O88516 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms