Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnnt1O88346 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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