Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd46O88174 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cd46O88174 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cd46O88174 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cd46O88174 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd46O88174 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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