Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1O70583 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms