Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms