Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb5O70309 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms