Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lnx1O70263 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms