Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms