Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sap18O55128 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms