Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrxO55103 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PrxO55103 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrxO55103 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrxO55103 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrxO55103 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrxO55103 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrxO55103 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrxO55103 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrxO55103 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms