Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr1O55100 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms