Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copb2O55029 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copb2O55029 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms