Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NlkO54949 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NlkO54949 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NlkO54949 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NlkO54949 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NlkO54949 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NlkO54949 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NlkO54949 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms