Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f6O54917 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms