Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp10aO54827 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp10aO54827 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms