Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek2O35942 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek2O35942 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms