Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms