Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pik3cdO35904 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms