Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl25O35903 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl25O35903 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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