Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a6O35544 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a6O35544 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms